和长谷川等人回合，成功找到线索，六大剑馆遭遇灭门，矛头直指主角。

众人得知冒充主角的是龙之介，组织是掘墓人，并得知这个组织准备今晚引爆炸弹，毁灭京都。

牧村得到幕府的帮助，随后见到了名为龙之介的男人，也就是自己的好友顺六。

主角向六大剑馆的敌人发送战书，攻打二条城，牧村和顺六兄弟反目，展开决斗，最后顺六手下留情，心甘情愿赴死。

上百位掘墓人出现，纷纷加入对主角的围剿，随后主角连杀数百人，又迎战嗑药进入夜叉境界的幸太郎。

主角进入无我境界，经过一番苦战，击杀幸太郎，名震天下。

主角得知研究不死人医生的下落，随后和木下琳合作，传授近藤内藏助剑法，近藤创出天然理心流。

主角向阿町表白，二人在一起了，随后主角开始疯狂训练刷经验，接着主角和葫芦屋一起前往江户。

主角混入四郎兵卫，成为临时工，单刀击败宝藏院流枪术的传人石田，被众多敌人关注。

主角抓到通缉犯，接着和火付盗贼改产生冲突，一个人将其全部击倒，随后牧村在长谷川口中得知御前试合的真相。

主角和长谷川合作，决定参加御前试合，意外拿到文试第一，接着和木下源一一起行动，击杀源一的仇敌。

老中松平定信找主角见上一面，邀请主角成为他的小姓，接着主角偶遇不知火忍者，和瞬太郎交战片刻。

主角救援瓜生秀，主动暴露身份，和进入夜叉境界的极太郎交手，帮助瓜生秀复仇成功。

不知火内部发生叛乱，丰臣家的旧部联合出击，除去了炎魔，并拉拢瞬太郎入伙。

炎魔使用影舞者脱身，和源一见面，接着二人放下了仇怨，炎魔假死脱身，归隐田园。

众人对不知火开启总攻，决战打响，间宫爆种击杀真太郎，主角击败瞬太郎，步入到无我境界之上的境界。

木下源一击杀一心求死的炎魔，在源一口中，主角得知无我境界之上是通透境，继续吸收不死，属性得到提升。

主角和阿町举办婚礼，丰臣信秀带着家臣大闹奉行所，并将世人宣告，丰臣家的回归。

主角前往锦夜町，找到通往虾夷地的船，接着开始踢馆刷级，又成为剑馆的食客。

主角接受村民的委托，上山剿灭山贼，跟着商队前往虾夷地，击杀一头棕熊，结识艾亚卡。

主角在奇拿村遭遇哥萨克人的袭击，和斯库卢奇一起帮助村民击退哥萨克人，接着进入红月要塞。

主角接受林子平的请求，答应帮其证明身份，在寻找村庄途中救下松平定信，身份暴露。

主角等人在返程的路上遭遇军队袭击村庄，主角愤而出手，随后在遇到前来追击的部队，阿町受伤。

主角开始复仇，一人冲击幕府第一军大营，大闹敌营，击杀最上，完成复仇。

阿町回到红月要塞养伤，幕府军兵临城下，主角一骑冲阵，杀出重围，向斯库卢奇求助。

主角带着斯库卢奇和其部下回归，创造奇迹，以寡击众，连破七阵，斩杀幕府统帅稻森。

主角和林子平出发，开始寻找医生的道路，随后找到玄直，得知不死的部分真相。

主角前往高野山，途遇少女阿筑，学习伊贺流禁术，又遭遇海盗，主角提剑将其击杀。

主角的面具被毁，身份曝光，发现有神秘组织追杀自己，又拒绝起义军的邀请。

阿筑讲述身世，并加入主角队伍，间宫九郎回到家里救出阿竹，与父亲决裂，将其击败。

主角击退幕府军队事迹开始传播，威震天下，接着主角前往京都，和风魔小太郎结伴，准备前往大阪。

主角在大阪遇到葫芦屋成员和一色爷孙二人，丰臣信秀